Titulaire de nombreux prix, Jan Overduin remporta le prix Healey Willan en 1963 et fut lauréat du festival international d'orgue tenu à London, en Ontario en 1967, du Concours de Bruges en Belgique en 1970 et du Festival d’orgue de Saint Albans au Royaume-Uni en 1973. Dans les années 60, il reçut de nombreuses bourses du CAC pour étudier à l’étranger avec, entre autres,  Marie-Claire Alain, Jean Langlais et Peter Hurford.

En 1978, il commença à enseigner à l'Université Wilfrid Laurier où il était en 1991 professeur d'orgue et de théorie et dirigeait le chœur de l'université. De 1979 à 1984, Overduin dirigea le Mennonite Mass Choir comprenant de 300 à 400 voix. En 1985, il devint directeur de musique à l'église luthérienne Saint Matthew à Kitchener. À partir de 1983, il a effectué des tournées annuelles en Europe, se produisant en Allemagne, en France, en Hollande, en Suisse et au Portugal. Il s'est fait entendre en récital à la SRC, à la BBC et à la radio belge. Il a également donné des récitals lors des congrès du CRCO.

Il est l’auteur de “Making Music – Improvisation for Organists” (OUP, 1998), une distillation de 25 ans d’enseignement en improvisation à l’Université Wilfrid Laurier à des étudiants aux habiletés et expériences diverses.  En 2005, la Kitchener-Waterloo Arts Foundation lui rend hommage avec un “Lifetime Achievement Award”.